Прошел год с того момента, как закончились события, происходящие в части имеющей название "Дети Пришествия". Люди, которые всяческими методами стараются забыть то, что забыть невозможно, понемногу начинают возрождать свою прежнюю жизнь. В этих начинаниях им помогает одна организация под названием W.R.O., она имеет довольно символическое наименование - "Всемирная Организация Восстановления". И вот, однажды, при раскопках руин, которые остались от складов корпорации Шин-Ра, был найден странный объект, на изучение которого сочли целесообразным послать специально подготовленную группу. Но ответа по данному объекту не последовало, по скольку группа таинственно исчезла. Буквально в это же время в городе под названием Кан ни с того, ни с сего появляются воины этой же загубленной корпорации. Что же творится в этом мире теперь?